Лікарня Некер є одним з найкращих медичних закладів, в якому лікують численні захворювання у дітей і деякі типи захворювань у дорослих. У 2004 році французьке міністерство охорони здоров'я надало лікарні звання «висококваліфікованого медичного центру по лікуванню рідкісних захворювань».

Лікування дітей у Франції в клініці Некер проводиться більш, ніж в 30 відділеннях. У лікарні займаються лікуванням спадкового імунодефіциту, вроджених вад серця, серповидної клітинної анемії, різних спадкових захворювань, гіпервентиляційного синдрому і спадкових захворювань нирок. Крім того, лікарня вважається головним педіатричним центром, який приймає маленьких пацієнтів з усього світу. Кращий педіатр у Франції - це педіатр з клініки Некер!

Отоларингологічне відділення - найбільше в Європі. Тут займаються лікуванням таких захворювань:

- глухота і різні захворювання, пов'язані з вухом (інфекції вуха, важкі або хронічні),

- ніс, носова порожнина (інфекції, алергії, доброякісні пухлини), аномалії гортані (вроджені дефекти),

- добро чи злоякісні пухлини.

Стоматологічне відділення і відділення щелепно-лицевої і пластичної хірургії - висококваліфіковані відділення, визнані на міжнародному рівні. Знімаются лікуванням різних патологій особи і порожнини рота (пороки розвитку, доброякісні та злоякісні пухлини, різні травми), а також лікуванням судинних пухлин і судинних вад розвитку.

Тут також здійснюють внутрішньоутробні діагностики, що стосуються дефектів розвитку і судинних аномалій, а медичний персонал спеціалізований в наданні психологічної допомоги необхідної для людей, що мають дефекти розвитку.

Нейрохірургічне відділення - єдине відділення паризького округу, яке лікує дітей з численними травмами. Включає в себе: педіатричну хірургію в області онкології, лікування черепно-лицевих вад розвитку, хірургію хребта і спинного мозку (в тому числі після травми), лікування порушення мозкового кровообігу іцереброваскулярних захворювань.

Як і більшість лікарень (CHU) у Франції, Некер працює за 3-ма напрямками:

- лікування,

- наукові дослідження,

- навчання.

Медичний персонал лікарні спеціалізований в 5 основних областях: генетика, імунологія, трансплантація, урологія - нефрологія і лікування вроджених вад розвитку. Лікарня займається лікуванням різних патологій, в тому числі найрідкісніших, і пропонує свою допомогу в екстрених випадках.